扬州大学的专业设置非常广泛，涵盖了多个学科领域，包括但不限于以下专业：
理工科类专业
计算机科学与技术
数学与应用数学
物理学
化学
电子信息科学与技术
微电子科学与工程
光电信息科学与技术
农业类专业
动物科学
植物科学
农学
种子科学与工程
植物保护
园艺
动物医学
医学类专业
临床医学
护理学
药学
文学类专业
英语
汉语言文学
新闻学
社会科学类专业
教育学
心理学
社会工作
经济管理类专业
会计学
工商管理
金融学
特色专业
动物医学专业（国家级一流本科专业建设点）
其他专业
哲学
美术学
艺术设计
服装设计与工程
音乐表演
信息与计算科学
统计学
应用化学
海洋资源与环境
生态学
生物技术
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