墨西哥的自治大学中最为著名的有：
墨西哥国立自治大学（Universidad Nacional Autonoma de Mexico - UNAM）
创建于1551年，是墨西哥和拉丁美洲地区历史最悠久、规模最大的综合性大学之一。
提供从学士学位到博士学位的上百种课程。
拥有30万名学生，25000名教师。
在世界大学排名中位于第一百五十名至二百名之间。
校园由20世纪墨西哥一些最著名建筑师所设计，并被联合国教科文组织列为世界文化遗产。
墨西哥国立理工学院（Instituto Nacional Politecnico - IPN）
位于墨西哥城中北部，是墨西哥最大的公立理工学院。
地位相当于中国的清华大学。
这两所大学在墨西哥及拉丁美洲地区享有极高的声誉，并在各自的专业领域内具有显著的影响力