海军大学（海军工程大学）提供多种硕士专业，包括但不限于以下领域：
工学专业
动力工程及工程热物理
电气工程
信息与通信工程
控制科学与工程
船舶与海洋工程
兵器科学与技术
核科学与技术
理学专业
数学
应用数学
机械工程
材料科学与工程
管理学专业
管理科学与工程
军事学专业
军事思想
军事历史
海军战略学
海军战役学
海军合同战术学
海军作战指挥
海军后勤组织指挥
专业学位硕士
工程硕士（包括机械工程、材料工程、动力工程、电气工程、电子与通信工程、控制工程、计算机技术、船舶与海洋工程、兵器工程、核能与核技术工程、项目管理等）
军事硕士
工程管理硕士
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