新疆拥有众多高等教育机构，以下是部分知名的大学和学院列表，排名不分先后：
新疆大学
简称“新大”
位置：新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐
层次：国家重点大学、国家“211工程”建设高校、国家西部大开发重点建设高校
塔里木大学
位置：新疆南部塔里木河畔的阿拉尔市
层次：中西部高等教育振兴计划高校
新疆农业大学
位置：新疆
层次：自治区重点建设的一所农业高等院校
石河子大学
位置：石河子市
层次：国家重点大学、国家“211工程”重点建设高校、国家西部重点建设高校
新疆医科大学
位置：新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市
层次：省属重点大学、国家卫生和计划生育委员会、教育部和新疆自治区共建高校
新疆师范大学
位置：新疆
层次：本科学校
喀什大学
位置：喀什地区
层次：本科学校
伊犁师范大学
位置：伊犁哈萨克自治州
层次：本科学校
新疆财经大学
位置：新疆
层次：本科学校
新疆艺术学院
位置：新疆
层次：本科学校
新疆工程学院
位置：新疆
层次：本科学校
昌吉学院
位置：昌吉回族自治州
层次：本科学校
以上信息基于最近的数据更新，具体院校名单和层次可能会有变动，建议访问教育部官方网站或相关院校的官方网站获取最新信息