中澳合作办学的大学包括但不限于以下几所：
华东理工大学与澳大利亚堪培拉大学合作举办工商管理硕士学位教育项目。
上海纽约大学（NYU Shanghai）。
香港科技大学-中山大学联合国际学院（SZTU-XISU）。
北京大学（Peking University）- 澳洲国立大学（Australian National University）。
沈阳工业大学与澳大利亚格里菲斯大学合作。
青岛大学国际商学院与澳大利亚南十字星大学合办中文MBA班。
南京大学与澳大利亚墨尔本皇家理工大学合办五年制中医学专业。
北京自修大学与澳大利亚JCE学院合办工商管理课程。
四川大学与澳大利亚维多利亚大学合办中澳联合办学项目。
广州大学与澳大利亚新南威尔士州。
此外，澳门本地的高校中， 澳门大学在横琴粤澳深度合作区设有新校区，预计于2028年投入使用。澳门大学通过“粤港澳高校联盟”等加强与内地高校的交流合作。