国立西南联合大学：
1938年由国立北京大学、国立清华大学和私立南开大学联合组成，在昆明成立，是中国抗日战争时期的重要高等教育机构。
云南师范大学：
其前身为1938年成立的国立西南联合大学师范学院，1946年三校北返后，师范学院留在昆明独立建校，后更名为云南师范大学。
昆明理工大学：
起源于1954年独立出来的云南大学工学院，后与云南工业大学合并，形成了现在的昆明理工大学。
西南林业大学：
最早可追溯到1938年创建的云南大学森林系，1958年独立为昆明农林学院，后与云南农业大学合并，最终定名为西南林业大学。
中国科学院大学昆明生命科学学院：
2013年，中国科学院大学来到昆明，设立中国科学院大学昆明生命科学学院。
北航云南创新研究院：
未找到具体成立年份，但属于近期在云南设立的研究机构。
云南大学：
云南省唯一的一所211工程大学，历史悠久，始建于1922年，前身是私立东陆大学。
昆明医科大学 、 云南中医药大学、 云南财经大学、 云南民族大学、 云南艺术学院、 昆明冶金高等专科学校、 云南交通职业技术学院、 云南经济管理学院、 云南交通运输职业学院、 云南农业大学、 昆明医学院、 云南中医学院、 云南教育学院、 云南体育进修学院、 云南银行学校：
这些大学中有些是在云南成立的，有些是在云南有重要影响。
建议：
云南师范大学和 昆明理工大学是云南最为知名的高等教育机构，历史悠久，学术实力雄厚。
中国科学院大学昆明生命科学学院和 北航云南创新研究院是近年来在云南设立的高水平研究机构，具有很大的发展潜力。
云南大学作为云南省的龙头高校，在多个学科领域都有显著的学术贡献。