万州区的公办大学包括：
重庆三峡学院：
由重庆市人民政府举办，入选首批“卓越农林人才教育培养计划”、教育部数据中国“百校工程”、“重庆市2011协同创新中心”，是一所位于三峡库区腹地的以文、工为主，其他学科专业协调发展的公办全日制普通本科院校。
重庆三峡医药高等专科学校：
位于重庆市万州区，2006年经重庆市人民政府批准由原万州卫校、原万县中医药学校合并升格组建。2016年8月，入选第二批国家现代学徒制试点单位。
重庆幼儿师范高等专科学校：
位于重庆市万州区。
重庆安全技术职业学院：
位于重庆市万州区。
重庆三峡职业学院：
前身分别是“国家级重点中专”万州农业学校和“省部级重点中专”万州工业学校，两校合并后资源升级重组。学校在80余年的办学历程中，曾多次开办大学专科，成立过专科学院。
建议：
如果主要关注本科专业，那么重庆三峡学院是首选。
对于医药类专业，重庆三峡医药高等专科学校是一个重要选择。
如果考虑职业技能教育，重庆信息技术职业学院和重庆三峡职业学院都有各自的优势专业。