北京东城区的名牌大学包括：
北京协和医学院：
位于北京，是一所历史悠久的医学院校，具有较高的学术地位。
中央美术学院：
位于北京东城区校尉胡同5号，是中国著名的美术高等教育机构。
清华大学：
位于北京，是中国最顶尖的大学之一，在多个排名中名列前茅。
北京大学：
同样位于北京，是中国历史最悠久、影响最大的综合性大学之一。
北京航空航天大学：
位于北京，是中国航空航天领域的重要高等教育机构。
中国人民大学：
位于北京，是中国人文社会科学领域的重要高等教育机构。
中国政法大学：
位于北京，是中国法律教育的重要基地。
北京邮电大学：
位于北京，是中国通信和信息技术领域的重要高等教育机构。
北京交通大学 （原北方交通大学）：位于北京，是中国铁路交通领域的重要高等教育机构。对外经济贸易大学：
位于北京，是中国国际贸易和经济领域的重要高等教育机构。
北京大学医学部（原北京医科大学）：位于北京，是中国医学领域的重要高等教育机构。
中央财经大学：
位于北京，是中国财经领域的重要高等教育机构。
首都师范大学：
位于北京，是中国师范教育领域的重要高等教育机构。
中国农业大学：
位于北京，是中国农业科学领域的重要高等教育机构。
北京语言大学：
位于北京，是中国语言和文学教育领域的重要高等教育机构。
以上信息根据最近的数据更新整理得出，具体情况可能会有所变化，建议访问各大学的官方网站或相关教育部门获取最新信息