2000年代中国大学排名如下：
1. 清华大学
2. 北京大学
3. 南京大学
4. 复旦大学
5. 中国科学技术大学
6. 浙江大学
7. 上海交通大学
8. 南开大学
9. 天津大学
10. 哈尔滨工业大学
建议：
清华大学和北京大学在2000年代一直是中国最顶尖的两所大学，地位稳固。
南京大学在2000年排名第三，但近年来发展迅速，已位列全国第六。
复旦大学和中国科学技术大学也是国内顶级高校，但在2000年的排名中略低于南京大学。
浙江大学和上海交通大学在2000年的排名中紧随其后，近年来也有显著的提升。
南开大学和天津大学在2000年表现突出，排名较高，但近年来排名有所下滑。
哈尔滨工业大学在2000年排名第十，但近年来发展迅速，已位列全国前十。