慕尼黑大学（Ludwig-Maximilians-Universität München, LMU Munich）的系别设置如下：
数学与自然科学部（Mathematics and Natural Sciences）：
数学学院
物理学院
化学学院
工程与建筑学部（Engineering and Architecture）：
航空与测量学院
土木与环境工程学院
建筑学院
机械工程学院
电气工程与计算机学院
信息学院
生命与健康科学部（Life Sciences and Health Sciences）：
生命学院
医学院
体育与健康科学学院
社会科学部（Social Sciences）：
教育学院
治理/行政学院
商业管理学院
人文科学（Humanities）：
天主教神学院
基督教神学院
法学院
企业经济学院
国民经济学院
医学院
牙医学院
兽医学院
历史及艺术学院
哲学，科学理论及宗教学院
心理学及教育学院
文化学院
语言学院
文学院
社会学院
数学、信息学及统计学院
物理学院
化学及药学院
生物学院
地质学院
这些学院和系别涵盖了从自然科学、工程、医学到社会科学、人文科学等多个学科领域，使其成为一所名副其实的综合性大学。