熊本大学的优势专业主要包括：
医学专业：
熊本大学是日本著名的医学高等教育和研究机构，其医学专业在国内外都有很高的声誉。该校的医学专业在QS世界大学排名中表现优异，药学与药理学专业位居世界151-200位，并列日本国内第八位，生命科学与医学专业位居世界第351位，日本国内第16位。此外，熊本大学还研制了世界首例的HIV治疗药，并在化工方面取得了显著成就，如开发出不易燃镁合金。
药学：
药学也是熊本大学的重要优势专业之一。在2017年QS世界大学学科排名中，药学与药理学专业位居世界251-300位，日本排名第十二位。
生命科学与医学：
该学科在2017年QS世界大学学科排名中位居世界第351位，日本国内第16位。
社会科学：
熊本大学的教育学、文学、社会学等专业也非常优秀，特别是社会学在学术研究和实际应用方面都有显著成果。
自然科学：
包括生物学、化学、数学、物理学等，这些专业在教学和科研方面都有很高的水平。
工程科学：
如材料工学、机械系统工学、社会环境工学、建筑学科、信息电器电子工学等，这些专业在工程实践和科技创新方面取得了显著成就。
其他专业：
如应用科学、信息与图书馆学、生物资源科学、信息科学、比较文化研究、综合国际科学、护理、地球科学、障碍科学、工程系统、科学教育学、人文社会、工程物理、社会研究、心理学、信息媒体发展研究等。
综上所述，熊本大学在医学、药学、生命科学与医学、社会科学、自然科学和工程科学等多个领域都有显著的优势和特色。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，重点关注这些优势专业。