福州历史上曾经存在过多所高等教育机构，以下是一些主要的大学及其历史沿革：
福建船政学堂（1866年创办）
全闽大学堂（1902年创建）
福建优级师范学堂（清朝结束前夕）
福建官立法政学堂（清朝结束前夕）
华英女学堂（清朝结束前夕）
私立福建法政学堂（清朝结束前夕）
福建协和大学（1911年创办，后与华南女子文理学院等合并为福州大学）
华南女子大学（1911年创办）
私立福建学院（1911年创办）
福建省立医学院（1949年创办）
福建省立农学院（1949年创办）
福建国立音乐专科学校（1949年创办）
福建省立师范专科学校（1949年创办）
福州大学（1951年创办，后复名福建师范学院，1972年复办后改名福建师范大学）
福建师范大学（1953年复名福建师范学院，1972年复办后改名福建师范大学）
福建农林大学（1958年创办，由福建协和大学农科和福建省立农学院合并组建）
福建医科大学（1937年创办，前身为福建省立医学专科学校）
福建中医药大学（1958年创办）
闽江学院（2002年创办）
福州业余大学（1958年创办，后成为福建省首批验收审批的成人高校）
福州市工人业余大学（1959年创办，后成为福建省首批验收审批的成人高校）
福建广播电视大学福州分校（1979年创办）
这些大学在不同时期经历了创办、合并、更名等过程，为福州乃至福建省的教育事业做出了重要贡献。