澳门大学在多个学科领域都有较强的实力，以下是一些被广泛认为较好的学科：
工程学
涵盖了电子工程、土木工程、机械工程等专业领域。
在ESI（Essential Science Indicators）排名中进入前百分之一。
计算机科学
包括计算机科学与技术、人工智能、数据科学等方向。
同样在ESI排名中表现优异。
化学
包含有机化学、无机化学、分析化学等领域。
在ESI排名中也进入了前百分之一。
心理学
包含认知心理学、社会心理学、临床心理学等多个研究方向。
电机及计算机工程
在校友会网发布的学科专业排行榜中被评为6星级学科专业（中国顶尖学科专业）。
葡萄牙语 、 会计及信息管理、 葡文法学
同样被评为6星级学科专业。
中医药、 土木及环境工程、 计算机科学、 机电工程、 应用数学、 财务及企业经济
被评为5星级学科专业（中国一流学科专业）。
生物医药学、 数学、 电子商业、 政府与行政、 教育学、 英文、 中文、 传播学
被评为4星级学科专业（中国高水平学科专业）。
此外，澳门大学的工商管理学院获得了AACSB、EQUIS和AMBA三重认证，其金融学、药物科学与科技、酒店及休闲管理、语言学、教育培训等专业也享有较高的声誉。