南京审计大学设有多个学院和部门，以下是部分学院和部门的列表：
政府审计学院
会计学院
商学院
公共管理学院
金融学院
经济学院
法学院
统计与数学学院
信息工程学院
文学院
外国语学院
马克思主义学院
艺术教育部
体育教研部
继续教育学院
国际文化交流学院
国际学院
瑞华审计与会计学院（挂靠会计学院）
国际审计学院（挂靠会计学院）
经济与金融研究院（挂靠金融学院）
工程管理与审计学院（挂靠信息工程学院）
中内审学院（挂靠政府审计学院）
书院
此外，学校还有对外联络办公室，负责对接审计干部教育学院的综合性协调服务工作。
请注意，以上信息可能不全面，建议访问南京审计大学的官方网站或直接咨询学校以获取最准确和最新的信息