日本东京拥有众多著名大学，以下是部分知名大学列表：
国立大学
东京大学
东京工业大学
一桥大学
东京医科齿科大学
东京外国语大学
御茶水女子大学
东京艺术大学
东京学艺大学
东京海洋大学
东京农工大学
电气通信大学
政策研究大学院大学
公立大学
首都大学东京
产业技术大学院大学
私立大学
庆应义塾大学
早稻田大学
上智大学
国际基督教大学
东京理科大学
明治大学
中央大学
青山学院大学
立教大学
法政大学
学习院大学
日本大学
驹泽大学
东洋大学
这些大学中，东京大学、早稻田大学和庆应义塾大学等在全球及亚洲具有较高的声誉和排名。