南通大学设有多个学院，以下是一些主要的学院及其专业设置：
文学院：
汉语言文学、汉语言文学（师范）、汉语国际教育、秘书学、新闻学、历史学（师范）。
数学与统计学院：
数学与应用数学（师范）、应用统计学。
物理科学与技术学院：
物理学（师范）、光电信息科学与工程。
马克思主义学院：
思想政治教育（师范）。
教育科学学院：
小学教育、学前教育、应用心理学、教育技术学。
教师教育学院：
教师教育管理处合署。
外国语学院：
英语、英语（师范）、翻译、商务英语、日语。
化学化工学院：
化学工程与工艺、应用化学、环境工程、高分子材料与工程、化学（师范类）。
机械工程学院：
机械工程、机械电子工程、机械设计制造及其自动化、测控技术与仪器。
信息科学技术学院：
电子信息工程、通信工程、电子科学与技术、集成电路设计与集成系统、计算机科学与技术、软件工程、物联网工程、数据科学与大数据技术、软件工程（嵌入式培养）。
电气工程学院：
自动化、电气工程及其自动化、建筑电气与智能化、电气工程与智能控制。
纺织服装学院：
纺织工程、轻化工程、非织造材料与工程、服装设计与工程、服装与服饰设计、表演（服装表演方向）。
医学院（护理学院）：
临床医学、口腔医学、医学影像学、生物信息学、康复治疗学、护理学。
公共卫生学院：
预防医学、医学检验技术。
体育科学学院：
体育教育、社会体育指导与管理。
艺术学院（建筑学院）：
美术学（师范类）、美术学、视觉传达设计、产品设计、工业设计、环境设计、动画、建筑学、音乐学、音乐表演。
地理科学学院：
地理科学（师范）、地理信息科学、自然地理与资源环境、人文地理与城乡规划、旅游管理、环境科学。
交通与土木工程学院：
交通工程、交通运输、交通设备与控制工程、土木工程、工程管理。
药学院：
药学、药物制剂学。
国际教育学院。
继续教育学院。
杏林学院（独立学院）。
神经再生重点实验室（与神经科学系、神经再生协同创新中心合署）。
以上信息仅供参考，具体学院和专业设置可能会有变动，建议访问南通大学官网获取最新信息。