海南大学与多个国际合作伙伴建立了合作关系，其中包括但不限于以下机构：
1. 中国热带农业科学院
2. 开罗大学（埃及）
3. 马来亚大学（马来西亚）
4. 马来西亚国油科技大学
5. 圣保罗大学（巴西）
6. 万隆理工学院（印度尼西亚）
7. 朱拉隆功大学（泰国）
海南大学还与其他国际高校和科研机构建立了合作关系，例如：
新加坡国立大学
莫斯科国立大学
俄罗斯科学院
美国加州大学戴维斯分校
爱尔兰都柏林理工大学
新西兰梅西大学
海南大学通过这些合作，推动了教育、科研和人才培养的国际化，为学生提供了丰富的国际交流和合作机会。