全国拥有教堂的大学包括：
北京燕京大学- 拥有教堂，由四所美国及英国基督教教会联合在北京开办。
北京辅仁大学- 创办时设有教堂，是民国时期一所由教会创办的私立大学。
上海圣约翰大学- 前身为圣约翰书院，是中国首个全英语授课的大学，有“东方哈佛”和“外交人才养成所”之雅称。
上海震旦大学- 由法国天主教耶稣会在上海创办，是中国近代著名高校。
杭州之江大学- 由基督教美北长老会和美南长老会在杭州联合创办。
广州岭南大学- 创办时设有教堂，是河南康乐创办的一所教会大学。
长沙湘雅医学院- 由雅礼会创办，湘雅医学院内设有教堂。
天津津沽大学- 创办时设有教堂，由天主教法国耶稣会在天津创办。
济南齐鲁大学- 由来自美国、英国以及加拿大的多个基督教教会组织联合开办。
成都华西协和大学- 创办时设有教堂，是中国近代著名高校之一。
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