安徽交通大学目前开设了 36个高职专业，这些专业覆盖了交通运输、土木建筑、装备制造等8个专业大类17个专业类。具体专业包括：
1. 土木工程
2. 汽车与机械工程系
3. 城市轨道交通与信息工程系
4. 管理工程系
5. 航海系
6. 文理科学系
7. 基础系
8. 成教部
此外，学校还设有36个高职专业，具体专业包括：
1. 交通运输
2. 土木建筑
3. 装备制造
4. 电子信息
5. 化工技术
6. 医药健康
7. 农林牧渔
8. 交通运输类
9. 土木建筑类
10. 装备制造类
11. 电子信息类
12. 化工技术类
13. 医药健康类
14. 农林牧渔类
15. 财经商贸类
16. 文化艺术类
17. 旅游类
18. 公安类
19. 法律类
这些专业中，道路桥梁工程技术、汽车运用与维修、物流管理、交通安全与智能控制被评为国家骨干高职院校重点建设专业；道路桥梁工程技术、高等级公路维护与管理被评为国家高职高专教育专业教学改革试点专业；土木工程检测技术、工程造价、工程机械运用于维护、汽车技术服务与营销、航海技术、会计、城市轨道交通运营管理、城市轨道交通控制被评为安徽省特色专业。