日本心理学专业大学院排名如下：
东京大学
东京大学是日本最早设立心理学专业的大学，其心理学专业与哲学、生物学、医学等很多领域相结合来研究各种心理现象。人文社会系研究科设有基础文化研究专攻的心理学研究室，主要围绕基础心理学展开研究，在教育学研究科也设有教育心理学和临床心理学课程。
京都大学
京都大学的心理学专业在世界大学心理学专业排名中位于上位，主攻基础心理学、实验心理学和基础行动等领域。研究科下设了实验心理学、教育心理学/临床心理学、生理心理学等三种不同心理学专攻。
庆应义塾大学
庆应义塾大学的心理学隶属于社会学部，专业始于1877年，以传统实验心理学为主。该校在心理学方面的学科设置主要偏重于基础心理学与发展临床心理学。
筑波大学
筑波大学是日本著名的国立综合大学，入选日本“超级国际化大学计划Top Global University Project”A类顶尖校，日本学术研究恳谈会RU11成员。心理学专业在日本具有较高的知名度。
早稻田大学
早稻田大学在心理学方面的学科设置主要偏重于临床心理学，并且设有专门的企业心理学。该校在心理学专业的偏差值排名中表现优异。
大阪大学
大阪大学的心理学专业涉及临床心理学、教育心理学等领域，其在教育学研究科中设有心理学专攻。
横滨国立大学
横滨国立大学的教育学研究科设有教育设计（心理学）、特别支援·临床心理、临床心理学等方向。
名古屋大学
名古屋大学的教育发达科学研究科设有教育科学、心理发达科学，其在心理学专业方面也有一定的影响力。
九州大学
九州大学的人类环境学府设有实践临床心理学，是顶尖研究型国立综合大学之一。
这些大学在心理学专业方面都有各自的优势和特色，建议根据个人兴趣和研究方向选择合适的大学进行申请。