扬州大学的一些顶尖专业包括：
1. 临床医学
2. 计算机科学与技术
3. 数学与应用数学（师范类）
4. 微电子科学与工程
5. 机械设计制造及其自动化
6. 建筑学
7. 制药工程
8. 工程管理
9. 动物医学（农林类）
10. 生物技术
此外，根据最新的信息，扬州大学的植物与动物科学、农业科学、微生物学等专业在ESI排名中表现突出，可视为该校的顶尖专业。
请注意，专业的排名和受欢迎程度可能会随时间和各种因素（如学科发展、就业前景等）发生变化。因此，建议在选择专业时，还需考虑最新的排名信息和自身兴趣及职业规划