新疆大学最好的专业包括：
数学与应用数学：
该专业推荐指数为4.6，有123人推荐，入选了国家级一流本科专业建设点和国家特色专业。
电气工程及其自动化：
推荐指数为4.5，有138人推荐，入选了国家级一流本科专业建设点和国家特色专业。
法学：
推荐指数为4.3，有106人推荐，入选了国家级一流本科专业建设点，并在校友会2024新疆大学学科排名中位居新疆高校第1名，全国第74名。
化学：
该专业不仅入选了国家级一流本科专业建设点，还是ESI全球前1%学科，并在校友会2024新疆大学学科排名中位居新疆高校第1名，全国第40名。
计算机科学与技术：
入选了国家级一流本科专业建设点和国家“双一流”建设学科，并在校友会2024新疆大学学科排名中位居新疆高校第1名，全国第40名。
金融学：
推荐指数为4.3，有129人推荐，入选了国家级特色专业。
新闻学、机械工程、电子信息工程、自动化、通信工程、网络空间安全、能源与动力工程等：这些专业也被评为新疆大学的王牌专业。
综上所述，新疆大学最好的专业包括数学与应用数学、电气工程及其自动化、法学、化学和计算机科学与技术。这些专业在学术声誉、就业率和学科排名中均表现优异，建议优先考虑这些专业。