日本级别最高的大学排名如下：
S级大学
东京大学
京都大学
一桥大学
东京工业大学
A级大学
大阪大学
名古屋大学
东北大学
B级大学
广岛大学
神户大学
上智大学
东京理科大学
横滨国立大学
C级大学
金泽大学
长崎大学
首都大学
东京电气通信大学
东京艺术大学
御茶水女子大学
大阪教育大学
京都工艺纤维大学
名古屋工业大学
日本大学
东京学艺大学
这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了各大学的学术声誉、研究实力和国际影响力。建议在选择大学时，可以综合考虑这些排名信息，以找到最适合自己的学校。