日本历史专业较好的学校有以下几所：
东京大学：
作为日本顶尖综合性国立大学，东京大学的人文社会系研究科下设有多个与史学相关的专业，如日本文化研究、亚洲文化研究等。其在历史研究方面的实力非常强。
京都大学：
京都大学在文学研究科下设有历史文化学专攻，涵盖日本史、东方史、西南亚史、西方史和考古学等多个专业。该校在历史研究方面具有深厚的历史传统和广泛的研究领域。
东北大学：
东北大学的历史学科是其文学研究科的重要组成部分，起源于1736年的仙台藩藩校“明伦养贤堂”，拥有悠久的历史和学术传统。
筑波大学：
筑波大学也是日本历史专业较好的学校之一，其人文社会系研究科下设有相关的研究领域。
神户大学：
神户大学的历史专业也备受认可，其在人文科学研究科下设有相关的研究方向。
广岛大学：
广岛大学的历史学专业也较为出色，其在文学研究科下设有相关的研究领域。
千叶大学：
千叶大学的历史学专业也较为知名，其在人文社会系研究科下设有相关的研究方向。
金泽大学：
金泽大学的历史学专业也较为优秀，其在文学研究科下设有相关的研究领域。
庆应义塾大学：
作为私立知名学府，庆应义塾大学的历史专业也较为受欢迎，其在文学研究科下设有相关的研究方向。
一桥大学：
一桥大学在历史学研究方面也有很高的声誉，特别是在经济学和历史学的交叉领域。
根据以上信息，如果你希望在日本学习历史专业，东京大学和京都大学是首选，这两所学校在历史研究方面的实力和学术传统都非常强。此外，东北大学、筑波大学、神户大学、广岛大学、千叶大学、金泽大学、庆应义塾大学和一桥大学也都是不错的选择，具体选择可以根据你的研究方向和个人兴趣来决定。