日内瓦大学拥有多个强项专业，以下是一些主要优势专业：
生命科学：
包括分子生物学、生物信息学等领域，享有国际声誉。
医学专业：
特别是神经科学、遗传学和移植领域，是世界医学的领导者之一。
人文学院：
通过记录人类经验，人文学科不仅传授知识，还促进人类普遍精神和理解。
经济与社会科学学院：
包括经济学、管理学、金融学、统计学和信息系统等领域。
法学院：
在瑞士及全球范围内享有高排名，特别是在法学专业方面。
翻译学院：
日内瓦高级翻译学院（ETI）是全球历史最悠久、教学水平最高的翻译学院之一。
自然科学学院：
以优秀的研究质量和国际化的视野著称。
政治专业：
在瑞士及全球排名中均位于前列。
牙科专业：
在QS世界大学排名中位于第25位。
古典文学和古代历史专业：
在瑞士及全球排名中均表现优异。
此外，日内瓦大学还是欧洲研究型大学联盟（LERU）的成员，并在多个学科领域拥有高水平的研究。