日本拥有众多优秀的本科大学，以下是一些著名的日本本科大学：
国立大学
东京大学
主要院系：法学、医药、工程、信息、科学、农业、经济学、艺术与科学等。
京都大学
主要院系：文学、法学、理学、医学、药学、工学、农学、教育学、经济学等。
大阪大学
主要院系：文学、法学、经济学、理学、工学、药学、医学、牙科学等。
东北大学
主要院系：文学系、教育学院、法学系、经济系、理学部、医学系、口腔系等。
东京工业大学
主要院系：工学和理学。
一桥大学
主要院系：人文及社会科学领域。
名古屋大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
北海道大学
主要院系：包括自然科学、社会科学、人文科学等。
九州大学
主要院系：包括自然科学、社会科学、人文科学等。
私立大学
早稻田大学
主要院系：经济经营商科的中国学生较多，理工科中国学生相对较少。
庆应义塾大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
上智大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
明治大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
法政大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
立命馆大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
其他知名大学
横滨国立大学
主要院系：经济和经营学部。
樱美林大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
城西国际大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
新泻食料农业大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
弘前学院大学
主要院系：涵盖广泛的学科领域。
以上列举的只是一部分日本本科大学，日本共有746所高校，其中国公立大学占比26%，私立大学占比74%。每所大学都有其独特的特色和优势，选择哪一所学校取决于个人的兴趣和目标。