南通大学的专业排名如下：
临床医学：
投档线为578分，排名第1。
电气工程及其自动化：
投档线为557分，排名第2。
儿科学：
投档线为557分，排名第3。
机械设计制造及其自动化：
投档线为554分，排名第4。
生物技术：
投档线为548分，排名第5。
化学（师范类）：
投档线为547分，排名第6。
土木工程：
投档线为546分，排名第7。
交通工程：
投档线为546分，排名第8。
医学检验技术：
投档线为543分，排名第9。
教育技术学（师范类）：
投档线为542分，排名第10。
此外，南通大学的优势学科和王牌专业还包括：
ESI学科全球排名前1%：临床医学、神经科学与行为学、工程学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、化学、材料科学、分子生物与遗传学、计算机科学。
A级学科：经济与金融。
B+级学科：纺织工程、服装设计与工程、药物制剂、医学检验技术、康复治疗学、教育技术学、应用统计学、美术学、商务英语、临床医学、翻译、机器人工程、物联网工程、通信工程、应用心理学、药学、护理学、机械电子工程、思想政治教育、生物科学、汉语言文学、历史学、汉语国际教育。
国家级一流本科专业：学前教育、生物科学、应用心理学、交通设备与控制工程、行政管理、视觉传达设计等。
省级一流本科专业：历史学、物理学、电子科学与技术、医学影像学、口腔医学、药学、会计学、翻译、化学、地理信息科学、应用统计学、测控技术与仪器、软件工程、音乐学、工程管理等。
国家级特色专业：临床医学、电气工程及其自动化、英语、汉语言文学、预防医学。
省级品牌专业：临床医学、电子信息工程、电气工程及其自动化、小学教育、汉语言文学等。
建议：
临床医学、 电气工程及其自动化、 儿科学、 机械设计制造及其自动化、 生物技术等专业投档线较高，是南通大学的优势专业，建议优先考虑。
计算机科学与技术、 电子信息工程、 护理学等专业也是王牌专业，具有较高的教学水平和就业前景。
经济与金融、 小学教育、 学前教育等专业在省级和国家级一流本科专业中表现突出，适合对特定领域有兴趣的学生。