与铁路合作的大学包括但不限于以下几所：
北京交通大学：
与中国铁路总公司合作，共建铁道交通与物流研究院。
西南交通大学：
与中国铁路总公司合作，共建铁道与城市轨道交通研究院。
中南大学：
与中国铁路设计集团有限公司合作，共建铁道工程技术研究院。
兰州交通大学：
前身兰州铁道学院，与铁路行业有密切联系。
大连交通大学：
与中国国家铁路集团有限公司与辽宁省共建，以轨道交通为特色。
石家庄铁道大学：
由国家国防科工局、国家铁路局、教育部以及河北省人民政府合作共建。
华东交通大学：
由国铁集团、国家铁路局与江西省合作共建，以交通为特色。
东南大学：
合并了原南京铁道医学院，交通运输工程为国家一级重点学科。
同济大学：
曾有上海铁道大学并入，现有铁道与城市轨道交通研究院。
其他高校：
如长沙铁道学院并入中南大学，上海铁道大学并入同济大学，南京铁道医学院并入东南大学等，这些学校的专业设置也涵盖了铁路工程、运输管理、电气自动化等领域。
这些大学与铁路行业的合作体现在共建研究院、提供实习实训机会、培养专业人才等多个方面，为学生提供了与铁路相关的学习和发展机会。