吉首地区共有 两所高等院校，分别是：
吉首大学：
简称“吉大”，是国家民族事务委员会与湖南省人民政府省部共建大学，湖南省高水平建设大学，湖南省“双一流”建设高校。吉首大学成立于1958年4月，1978年复升为省属综合性大学，同年中南大学湘雅医学院湘西分院并入吉首大学组建医疗系，湘潭大学湘西分校并入吉首大学组建体育系，2000年，吉首卫生学校并入吉首大学；2001年，湘西民族教育学院与吉首民族师范学校并入吉首大学组建吉首大学师范学院；2002年，武陵高等专科学校并入吉首大学成为吉首大学张家界校区。
湘西民族职业技术学院：
是2004年5月经湖南省人民政府批准，教育部备案的湘西自治州唯一一所普通高等职业技术院校。
建议：
吉首大学是吉首地区最知名的高等院校，也是湖南省认定的一本院校，具有较高的教学水平和研究实力。
湘西民族职业技术学院则是一所专注于职业技能教育的高等院校，为湘西地区培养了大量应用技术型人才。