北京主要医科大学的排名如下：
北京协和医学院
排名情况：通常位列榜首。
简介：国家卫生健康委员会直属，与中国医学科学院实行院校合一管理体制，是国家“双一流”建设高校。
首都医科大学
排名情况：通常位列前茅，紧随北京协和医学院之后。
简介：北京市直属重点高等医学院校，由北京市政府、国家卫生健康委员会和教育部共同创办。
北京中医药大学
排名情况：位列前三。
简介：教育部直属，以中医药学科为特色，是国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设院校之一。
以上排名根据最近的信息整理得出，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。建议以教育部或相关权威机构最新公布的信息为准