日本本土的主要大学排名通常根据不同的标准和评估机构会有所变化，但以下是一些被广泛认可的排名情况：
QS世界大学排名
东京大学
京都大学
大阪大学
名古屋大学
筑波大学
北海道大学
早稻田大学
庆应义塾大学
九州大学
东京工业大学
ARWU（上海软科世界大学学术排名）
京都大学
东京大学
大阪大学
名古屋大学
筑波大学
北海道大学
早稻田大学
庆应义塾大学
九州大学
东京工业大学
日本国内排名
东京大学
京都大学
大阪大学
东京工业大学
东北大学
庆应义塾大学
九州大学
名古屋大学
北海道大学
筑波大学
以上排名可能会根据不同的评价标准和时间点有所变动。您可以根据自己的兴趣和需求，选择适合的大学进行申请。