当前全国理科前六所大学的排名如下：
清华大学
学科优势：涵盖数学、物理、化学、生命科学等多个领域，科研实力卓越。
北京大学
学科优势：在数学、物理、化学等基础理论研究方面具有深厚的积淀。
中国科学技术大学
学科优势：理工科强校，背景强大，与中国科学院有紧密联系。
复旦大学
学科优势：在数学、物理、化学等基础理论研究方面具有深厚的积淀，注重国际合作。
上海交通大学
学科优势：在电子信息、材料科学、航空航天等方向的研究在国际上有认可度。
南京大学
学科优势：在数学、物理、化学等基础理论研究方面具有深厚的积淀。
以上排名基于最近的信息，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。