神户大学提供广泛的专业选择，包括但不限于以下领域：
人文学科：包括哲学、历史学、文学、认知研究、社会文化等。
国际文化部：国际文化学。
发达科学部：人类形成学科、人类行动学科、人类表现学科、人类环境学科等。
法学部：法律学科。
经济学部：经济学科。
经营学部：经营学科。
理学部：数学、物理学、化学、生物学、地球行星科学等。
医学部：医学科、保健学科。
工学部：建筑学科、市民工学科、电气电子工程、机械工程、应用化学、计算机与系统工程等。
农学部：食品工程经济学、生命资源科学、农业生物学等。
海洋科学部：海洋技术经营管理学科、海洋物流科学、海洋工学技术学科等。
神户大学是日本现代经营学研究的发祥地，同时也是日本经济学、法学研究的重镇之一，拥有西日本地区规模最大的法学部，并在国际文化学方面具有实力。此外，神户大学还设有全日本大学中唯一的海事学部