上海共有14所大学进入全国百强高校，具体如下：
1. 上海交通大学
2. 复旦大学
3. 同济大学
4. 华东师范大学
5. 上海财经大学
6. 华东理工大学
7. 上海大学
8. 上海纽约大学
9. 上海科技大学
10. 东华大学
11. 上海外国语大学
12. 上海中医药大学
13. 上海理工大学
14. 上海师范大学
其中，上海交通大学、复旦大学、同济大学、华东师范大学为985高校，上海财经大学、华东理工大学、上海大学、东华大学、上海外国语大学、上海中医药大学、上海理工大学、上海师范大学为非985的211高校，上海纽约大学和上海科技大学为中外合作办学的高校