南京市玄武区拥有多所知名高等院校，包括：
东南大学
地址：南京市玄武区四牌楼
简介：东南大学是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的全国重点大学，建筑老八校及原四大工学院之一，国家首批双一流（A类）、211工程、985工程重点建设高校。
南京理工大学
地址：南京市玄武区孝陵卫
简介：南京理工大学是一所隶属于中华人民共和国工业和信息化部的全国重点大学，“双一流”世界一流学科建设高校，“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校。
南京农业大学
地址：南京市玄武区卫岗
简介：南京农业大学坐落于虎踞龙蟠的古都南京，是一所以农业科学与生命科学为优势和特色，农、理、经、管、工、文、法学多学科协调发展的教育部直属全国重点大学，是国家“双一流”、“211工程”。
南京林业大学
地址：南京市玄武区龙蟠路
简介：南京林业大学是一所由国家林业局和江苏省人民政府共建的省属重点大学，是国家首批“双一流”世界一流学科建设高校，入选国家首批“卓越农林人才教育培养计划”、“特色重点学科项目”。
南京大学
地址：南京市玄武区
简介：南京大学是一所综合性研究型大学，拥有悠久的历史和优良的学术声誉。
南京艺术学院
地址：南京市玄武区
简介：南京艺术学院是一所专业的艺术类学校，培养了众多优秀的艺术人才。
南京工业职业技术学院
地址：南京市玄武区
简介：南京工业职业技术学院注重工业技术和信息通讯领域的教育培养。
南京邮电大学
地址：南京市玄武区
简介：南京邮电大学是一所注重信息通讯领域教育培养的大学。
南京师范大学紫金校区
地址：南京市玄武区
简介：南京师范大学紫金校区是南京师范大学的主要校区之一。
南京体育学院
地址：南京市玄武区
简介：南京体育学院是一所专注于体育教育和研究的大学。
海军指挥学院
地址：南京市玄武区
简介：海军指挥学院是中国海军的重要指挥院校。
中国科学院南京分院
地址：南京市玄武区
简介：中国科学院南京分院是中国科学院的派出机构，集中了江苏省近三分之一的“两院”院士和南京市一半左右的省级以上重点实验室。
江苏省农业科学院
地址：南京市玄武区
简介：江苏省农业科学院是江苏省重要的农业科研机构。
南京博物院
地址：南京市玄武区
简介：南京博物院是中国三大博物馆之一。
南京图书馆
地址：南京市玄武区
简介：南京图书馆是亚洲第四大图书馆。
中国科学院紫金山天文台
地址：南京市玄武区
简介：中国科学院紫金山天文台被誉为“中国现代天文学的摇篮”。
这些高校和科研机构在各自的领域具有显著的成就和影响力，为南京玄武区的教育事业和区域经济文化的发展做出了重要贡献。