南京林业大学的王牌专业包括：
生态学：
作为学校的重点学科，生态学在教学和科研领域都有显著成就。
机械设计制造及其自动化：
这个专业将机械、电子、计算机等领域融合，培养具有创新精神的工程技术人才。
土木工程：
土木工程专业历史悠久，不断创新发展，涵盖建筑、交通、水利等多个领域。
轻化工程：
这个专业属于轻工类，是南京林业大学的特色专业之一。
交通工程：
涉及交通运输领域，是学校的重点专业之一。
木材科学与工程：
作为林业类院校的特色专业，木材科学与工程在南京林业大学有着深厚的历史和学术底蕴。
林产化工：
属于林业工程类，是化学工程学院的重点专业。
风景园林：
风景园林专业是建筑类专业的重点，注重理论与实践的结合。
水土保持与荒漠化防治：
这个专业属于自然保护与环境生态类，是林学院的重点专业。
林学：
林学是南京林业大学的传统优势专业之一。
森林保护：
属于林学类，是林学院的特色专业。
建议：
生态学和 林学是南京林业大学的传统优势专业，适合对生态环境和森林资源管理感兴趣的学生。
木材科学与工程和 林产化工是林业工程领域的王牌专业，适合希望从事木材加工、化学转化与利用的学生。
风景园林和 土木工程等专业则适合对城市规划和建筑领域感兴趣的学生。
这些专业在国内和国际上都有较高的知名度和影响力，就业前景广阔。建议根据个人兴趣和职业规划，选择最合适的专业进行深入学习。