开工申请监理工程师的意见通常包括以下几个方面：
开工准备情况
确认施工单位的人力、物力、财力是否准备就绪，包括管理人员、施工人员、机械设备和资金等。
检查相关报审工作是否已全部完成，包括施工组织设计、专项施工方案、复工申请等。
施工方案与质量保证
审查施工组织设计或施工方案是否审批手续齐全，内容是否完整，方案是否合理、可行，并满足施工总进度计划要求。
确认质量保证体系和安全保证措施是否健全，现场组织机构是否满足施工要求。
安全与文明施工
检查施工现场是否存在重大质量和安全隐患，是否已采取针对性的整改措施，并确认停工因素已全部消除。
强调文明施工和环保措施的重要性，确保施工过程中不影响周边环境。
沟通与协调
要求施工单位及时沟通施工过程中的任何问题，及时调整施工方案，确保工程顺利进行。
复工条件
对于复工申请，需确认承包单位已采取整改措施，停工因素已全部消除，相关证明文件齐全、有效。
总体意见
总监理工程师在审查所有相关报审材料后，会给出总体意见，包括是否同意开工或复工，以及需要落实的具体事项。
示例意见
同意开工
经审查，施工单位已完成开工前各项准备工作，工程相关报审资料齐全，具备开工条件，提请建设单位审批。
不同意开工
经检查，由于以下几项条件不具备，不同意开工，请尽快落实后报审。
同意复工
经审查，根据XXX工程暂停令要求，承包单位采取了针对性的整改措施，停工因素已全部消除，证明文件齐全、有效，具备复工条件，同意本工程于 年*月*日*:*时起全面复工。
需要修改
施工组织设计（方案）内容不完善，主要有a､b､c等项，请修改后再报。
这些意见旨在确保工程在开工前具备充分的条件，施工过程中能够保证质量和安全，同时要求施工单位与监理单位保持良好的沟通与协调。