造价工程师资格证书的发放单位如下：
一级造价工程师：
由住房城乡建设部、交通运输部、水利部负责注册及相关工作，并由这些部门核发《中华人民共和国一级造价工程师注册证》（或电子证书）。
二级造价工程师：
各省、自治区、直辖市的住房城乡建设、交通运输、水利行政主管部门按专业类别分别负责注册及相关工作，并由这些部门核发《中华人民共和国二级造价工程师注册证》（或电子证书）。
造价工程师执业资格证书：
由各省、自治区、直辖市人事（职改）部门颁发，该证书在全国范围内有效。
综上所述，一级造价工程师和二级造价工程师的注册证书分别由住房城乡建设部、交通运输部、水利部和各省、自治区、直辖市的相关行政主管部门核发，而造价工程师执业资格证书则由各省、自治区、直辖市人事（职改）部门颁发。