防止造价工程师证书挂靠可以采取以下措施：
签订详细的协议
签订注册协议书或聘用协议，而不是挂靠协议书。尽管协议可能不合法，但它能证明你的证书在这个企业。
和企业同时签订正式的社保局出具的劳动合同书，证明你是这个企业的员工，受法律保护。
确保社保和劳动合同的真实性
社保局出具的劳动合同书必须由企业盖公章和个人按手印，确保真实性。
明确证书使用和管理
让企业出具证书的收条，证明证书在企业里使用，并盖公章。
协议里详细注明付款情况，避免一次性付款，要求企业开具欠条，注明付款时间。
选择可靠的企业
不要和中介或代办机构签订协议，直接和需要证件的单位签订协议，确保对方有合法资质和信誉。
坚持合理的付款方式
递交材料当天付清全款，避免出现先付一半、再付一半或注册公示后再付款等情况。
了解相关法律法规
理性看待挂靠行为，了解《中华人民共和国建筑法》等相关法律规定，明确挂靠的违法性。
谨慎选择挂靠单位
在挂靠前，了解单位的名称、资质、地点、证书用途等，确保单位合法且使用证书的范围明确。
谈判合同时，明确价格、使用范围、印章使用等细节，避免后期纠纷。
确保印章安全
证书上的印章仅用于企业资质申报、年检等特定用途，避免用于其他可能涉及审计纠纷的文件。
通过以上措施，可以有效降低造价工程师证书挂靠的风险，确保自身权益不受损害。