监理工程师在处理梁柱等施工质量问题时，应遵循以下步骤：
及时制止并改正质量问题
当施工引起的质量问题尚处于萌芽状态时，监理工程师应及时制止，并要求施工单位立即改正。
发出监理通知并跟踪处理
当施工引起的质量问题已出现，监理工程师应立即向施工单位发出《监理通知》，要求其进行补救处理。在施工单位采取保证质量的有效措施后，监理工程师需向监理单位填报《监理通知回复单》。
填写不合格项处置记录
某工序分项工程完工后，如出现不合格项，监理工程师应填写《不合格项处置记录》，要求施工单位整改，并对其补救方案进行确认，跟踪其处理过程，对处理结果进行验收。不合格项不允许进入下道工序或分项工程施工。
签发监理通知并指令保修
在交工使用后保修期内，发现施工质量问题时，监理工程师应及时签发《监理通知》，指令施工单位进行保修（修补、加固或返工处理）。
协助事故调查组工作
监理工程师应积极协助上级有关主管部门组织成立的事故调查组工作，提供有关的证据。若监理方有责任，则应回避。
审核技术处理方案
总监理工程师接到事故调查组提出的技术处理意见后，可征求建设单位意见，组织有关单位研究并委托原设计单位完成技术处理方案，予以审核签认。
监督施工方案实施
处理方案核签后，监理工程师应要求施工单位制定详细施工方案，报监理审批后监督其实施处理。
组织检查验收
施工单位处理完工自检后报验结果，监理工程师应组织各方检查验收，必要时进行处理鉴定。
通过以上步骤，监理工程师可以有效处理梁柱等施工质量问题，确保工程质量符合设计和规范要求。