全国监理工程师的颁发部门主要是 中华人民共和国住房和城乡建设部。根据《中华人民共和国公职人员管理条例》的规定，获得监理工程师证书的，由住房和城乡建设部颁发证书。此外，监理工程师执业资格证书是由国家建设部、人事部统一命题和颁发的，可以在全国范围内选择相应专业执业。
具体颁发流程如下：
全国注册监理工程师：
由国家建设部、人事部统一命题和颁发执业资格证书，可以在全国范围内选择相应专业执业。其考试工作由建设部、人事部共同负责，日常工作委托建设部建筑监理协会承担，具体考务工作由人事部人事考试中心负责。
省级监理工程师：
只需取得省建设主管部门命题考试通过后颁发的监理工程师证书，可以在本省范围内选择相应专业执业的监理人员，无需注册，但其不能跨省市执业。
水利部监理工程师：
由水利协会颁发。
建议：
监理工程师证书分为全国注册监理工程师、省级监理工程师和水利部监理工程师，不同类别的证书颁发部门不同，建议根据具体需求和职业规划选择合适的证书类型。
由于政策和管理安排的变更，建议关注最新的官方通知和指南，以确保获取最准确的信息。