监理工程师在以下情况下需要签发工程暂停令：
施工单位未经批准擅自施工：
当施工单位在没有得到批准的情况下开始施工时，总监理工程师应及时签发工程暂停令。
施工单位拒绝项目监理机构管理：
如果施工单位拒绝执行项目监理机构的要求和指令，总监理工程师应视情况签发工程暂停令。
施工单位未按审查通过的工程设计文件施工：
当施工单位未按照经过审查的工程设计文件进行施工时，总监理工程师应及时签发工程暂停令。
施工单位违反工程建设强制性标准：
如果施工单位违反了工程建设强制性标准，总监理工程师应及时签发工程暂停令。
监理过程中发现工程存在安全事故隐患：
在监理过程中，如果发现工程存在安全事故隐患，总监理工程师应签发监理通知，要求施工单位整改；如果隐患严重，应签发工程暂停令。
建设单位要求暂停施工且工程需要暂停施工：
当建设单位要求暂停施工，并且工程确实需要暂停施工时，总监理工程师经过独立判断，认为有必要暂停施工的，可签发工程暂停令。
施工存在重大质量、安全事故隐患或发生质量、安全事故：
如果施工存在重大质量或安全事故隐患，或已经发生了质量或安全事故，总监理工程师应及时签发工程暂停令。
在签发工程暂停令时，总监理工程师应事先征得建设单位的同意，并在紧急情况下，未能事先征得建设单位同意的，应在事后及时向建设单位书面报告。此外，总监理工程师在签发工程暂停令时，应根据停工原因的影响范围和影响程度，确定停工范围，并严格按照施工合同和建设工程监理合同的约定执行。