二级建造师注销时，若聘用企业不配合提供解除劳动合同的证明，申请人可以通过以下途径办理注销：
申请劳动仲裁
申请人可以向劳动仲裁部门申请劳动仲裁，以确定劳动关系，并获取解除劳动合同的书面证明。
司法判决
如果劳动仲裁无法解决问题，申请人可以通过司法途径，如法院诉讼，获取法院判决书或裁定书，证明个人与聘用单位已无劳动关系。
网上投诉举报
申请人可以登录相关官方网站，如湖北省住房和城乡建设厅网站，进入“挂证”等违法违规行为专项整治信息系统进行网上投诉举报。
提交有效证明材料
申请人需要提交与原聘用单位解除劳动关系的有效证明材料，如解聘证明、劳动仲裁书或法院判决书等，以证明劳动关系已解除。
申诉与补充资料
若原聘用单位不配合办理注销手续，申请人可以向注册机构提交申请报告，说明情况并提供解除劳动关系的证明材料原件和复印件，进行申诉。
跨企业注销注册申请
申请人还可以通过相关政务服务网提出跨企业注销注册申请，上传所需的解除劳动合同协议书、劳动仲裁或司法判决等材料。
建议申请人在办理二级建造师注销时，先尝试通过劳动仲裁或司法途径解决劳动关系问题，确保有充分的证明材料，以减少不必要的麻烦和延误。