监理工程师证书的颁发部门如下：
全国注册监理工程师：
由 国家建设部和 人事部统一命题和颁发执业资格证书。具体考务工作由人事部人事考试中心负责，日常工作委托建设部建筑监理协会承担。
省级监理工程师：
由各省、自治区、直辖市的建设主管部门命题考试通过后颁发。这些证书可以在本省范围内选择相应专业执业，无需注册，但不能跨省市执业。
水利部监理工程师：
由水利协会颁发。
其他行业主管部门：
例如交通运输部、铁道部等也有各自的监理工程师资格证书颁发机制。
综合以上信息，可以得出以下结论：
全国注册监理工程师证书由 国家建设部和 人事部颁发。
省级监理工程师证书由各省、自治区、直辖市的建设主管部门颁发。
水利部监理工程师证书由水利协会颁发。
其他行业主管部门颁发的证书在各行业内部有效。
建议根据具体需求和所在地区，了解并确认相关证书颁发部门的具体要求和流程。