造价工程师项目组织结构可以根据不同的管理需求和工程特点来选择，常见的组织结构形式包括直线制、职能制、直线职能制和矩阵制。
直线制 优点
结构简单，权力集中，易于统一指挥，隶属关系明确，职责分明，决策迅速。
缺点：
未设职能部门，没有参谋和助手，要求领导者通晓各种业务，成为“全能式”人才，无法实现管理工作专业化，不利于项目管理水平的提高。
职能制 优点
强调管理业务的专门化，注意发挥各类专家在项目管理中的作用，管理人员工作单一，易于提高工作质量，同时可以减轻领导者的负担。
缺点：
多头领导，容易造成职责不清。
直线职能制 优点
集中领导，职责清楚，有利于提高管理效率。
缺点：
各职能部门之间的横向联系差，信息传递路线长，职能部门与指挥部门之间容易产生矛盾。
矩阵制 优点
根据工程任务的实际情况灵活地组建与之相适应的管理机构，具有较大的机动性和灵活性，实现了集权与分权的最优结合，有利于调动各类人员的工作积极性。
缺点：
矩阵制组织机构经常变动，稳定性差，每一个成员都受项目经理和职能部门经理的双重领导，如果处理不当，容易产生扯皮现象。
实际应用建议
小型项目：可以考虑采用直线制，因为其结构简单、权力集中，易于统一指挥和决策。
中型项目：可以采用直线职能制，既保持统一指挥，又能实现管理工作专业化分工。
大型或复杂项目：建议采用矩阵制，以便根据工程任务的实际情况灵活组建管理机构，调动各类人员的工作积极性。
案例分析
案例1：某大型工程项目，涉及多个专业和复杂的任务，采用矩阵制，项目经理由企业最高领导任命，全权负责项目，成员从各职能部门借调，并指定专案主持人，确保项目顺利进行。
案例2：某造价咨询项目，由公司主管领导挂帅，技术负责人担任项目负责人，成员由造价咨询部经验丰富的专业人员组成，采用直线职能制，确保审计服务工作的顺利开展。
通过以上分析，可以根据具体项目的需求和特点，选择最适合的组织结构形式，以提高项目管理效率和效果。