二级造价工程师在计算工程项目的间接费时，需要考虑以下几个主要方面：
企业管理费
包括管理人员的工资、办公费、差旅交通费、固定资产使用费、劳动保险费、工会经费、职工教育经费、财产保险费、财务费、税金等。
财务费用
主要涉及贷款利息、手续费等。
其他费用
包括免费项目管理系统费、工具用具使用费、投标期间开支的费用、保函手续费、保险费、税金等。
间接费定额的编制方法
间接费定额的编制方法有以直接费为计算基础、以人工费和机械费合计为计算基础、以人工费为计算基础三种。
间接费率的确定
间接费是计算间接费的数量标准，通过相应的计取基础乘以间接费率确定。
在实际操作中，造价工程师需要根据工程的具体情况和相关文件，合理确定间接费的基础数据和费率，以确保工程成本的准确计算。