监理工程师签发的文件主要包括以下几种：
监理通知单：
当项目监理机构在实施监理过程中发现工程存在安全事故隐患时，应签发监理通知单，要求施工单位整改。情况严重时，还应签发工程暂停令，并及时报告建设单位。
工程暂停令：
在工程存在严重安全隐患或施工不符合规范要求时，监理工程师有权签发工程暂停令，要求施工单位暂停施工，并进行整改。
工程变更通知书：
当工程发生变更时，监理工程师会下达变更通知书，通知相关的各方，包括业主、承包商和设计师等，说明变更的内容和影响。
施工图设计文件：
监理工程师需要对施工图设计文件进行审查，并在确定符合设计规范和技术标准后签字确认，以确保施工过程中严格按照设计文档施工。
质量验收文件：
工程完工后，监理工程师审核工程的施工质量合格后签字确认，该文件是后续维修、改建等工作的依据。
安全措施文件：
监理工程师需要签字确认安全措施文件，以确保施工过程中人员和设备安全。
工程复工令：
在施工单位整改完毕并符合相关规定后，监理工程师会签发工程复工令，允许施工单位恢复施工。
工程款支付证书：
监理工程师在审核工程进度和费用后，会签发工程款支付证书，作为业主向承包商支付工程款的依据。
结清单：
工程完工后，监理工程师会签发结清单，对工程的完成情况、存在的问题及处理意见进行总结。
这些文件是监理工程师在项目实施过程中进行质量、安全、进度和费用控制的重要手段，确保工程按照设计要求、技术规范和相关法规顺利进行。