监理工程师考试中最难的科目是 《建设工程监理案例分析》。在监理工程师考试中，共设有四个科目，分别是《建设工程合同管理》、《建设工程目标控制》、《建设工程基本理论与相关法规》和《建设工程监理案例分析》。其中，《建设工程监理案例分析》被普遍认为是最难的一科。
《建设工程监理案例分析》需要考生将其他几个科目的知识进行综合运用和灵活应用，因此相对较难。案例题通常比较灵活，需要长时间的理解和思考，这无形中增加了考试周期。此外，案例题还需要考生具备扎实的理论基础、良好的逻辑思维能力和实践经验，这对很多考生来说是一个挑战。
尽管《建设工程目标控制》、《建设工程监理基本理论和相关法规》和《建设工程合同管理》也有一定的难度，但它们在知识点的深度和广度上相对较为集中和明确，而《建设工程监理案例分析》则需要考生具备更全面的知识体系和应用能力，因此被认为是最难的科目。
综上所述，对于监理工程师考试来说，如果要在四科中选出最难的一科，那么《建设工程监理案例分析》无疑是最合适的选择。建议考生在备考过程中，特别重视这一科目的学习和练习，以提高考试通过率。