安全工程师存在的问题主要包括以下几个方面：
工作压力大，责任重：
安全工程师需要处理各种紧急情况，工作强度大，且需要承担重大的安全责任。
应急处理频繁：
由于安全问题的突发性，安全工程师需要经常进行应急处理，这对他们的应变能力和心理素质提出了较高要求。
加班多：
安全工程师的工作性质决定了他们需要经常加班，以应对可能的安全事件和事故。
晋升空间有限：
在一些组织中，安全工程师的晋升空间可能较小，这可能会影响他们的工作积极性和职业发展前景。
资质认证不够严格：
注册安全工程师的资质认证标准较为宽松，一些不具备相关技能和经验的人也能通过考试获得资格，导致市场上存在大量“冒充”安全工程师的人。
缺乏实践经验：
注册安全工程师的考试主要以理论为主，缺乏实践操作的考核，导致一些安全工程师在实际工作中遇到问题时无法妥善解决。
考试内容过于简单：
注册安全工程师的考试内容相对简单，难度不高，导致一些人通过考试后并没有真正掌握相关的知识和技能。
资质认证周期过长：
注册安全工程师的资质认证周期较长，需要每年进行继续教育，但是一些安全工程师并没有认真参加相关的培训和学习，导致他们的知识和技能无法跟上时代的发展。
资质认证费用高昂：
注册安全工程师的资质认证费用较高，对于一些初入行的安全工程师来说，可能会增加他们的经济负担。
知识更新慢：
安全工程师需要不断更新自己的知识和技能，但一些安全工程师可能由于工作繁忙或其他原因，未能及时学习和掌握最新的安全知识和技术。
沟通能力差：
安全工程师需要与各方进行有效沟通，但一些安全工程师在沟通能力方面存在不足，这可能会影响他们的工作效果。
系统漏洞：
安全工程师需要对系统进行全面的安全评估，发现并修复系统中存在的漏洞，以防止黑客攻击和数据泄露。
人为失误：
员工的疏忽和错误是造成数据泄露和安全漏洞的主要原因之一。安全工程师需要加强员工的安全意识教育，提高员工的安全意识和技能水平。
弱密码：
弱密码是黑客攻击的主要入口之一。安全工程师需要对系统中的密码策略进行评估和优化，确保密码的强度和安全性。
社交工程：
黑客利用社交工程的手段，通过欺骗和诱导的方式获取用户的敏感信息。安全工程师需要加强用户的安全意识教育，提高用户的防范能力。
未授权访问：
未授权访问是黑客攻击的主要手段之一。安全工程师需要对系统的访问控制进行评估和优化，确保只有授权用户才能访问系统。
恶意软件：
恶意软件是黑客攻击的主要工具之一。安全工程师需要对系统进行全面的安全检测和防御，确保系统没有被恶意软件感染。
数据泄露：
数据泄露是企业面临的严重安全威胁之一。安全工程师需要对系统中的数据进行分类和加密，确保敏感数据不会被泄露。
网络攻击：
网络攻击是黑客攻击的主要手段之一。安全工程师需要对网络进行全面的安全评估和防御，确保网络不会受到攻击。
人才流动性受限：
安全工程师注册制度限制了人才的流动性，使得从事安全工程师工作的人员只能在注册机构认可的范围内工作，无法自由选择工作单位。
企业成本增加：
企业需要聘请安全工程师来进行安全管理，而安全工程师注册制度的实施，使得企业需要支付更高的薪资和注册费用，增加了企业的成本负担。
注册机构权威性不足：
安全工程师注册机构的权威性难以保证，存在一些注册机构的资质不够，审核不严格，导致注册的安全工程师水平参差不齐，从而影响了整个行业的信誉和安全水平。
行业竞争力降低：
安全工程师注册制度的实施，使得从事安全工程师工作的人员需要通过考试才能注册，这样会降低行业的竞争力，限制了新人的进入，导致行业人才短缺。
无法完全保证安全：
安全工程师注册制度只是对从事安全工程师工作的人员进行了资格认证，但并不能完全保证安全工程师的工作质量和安全水平，因此不能完全保证企业的安全。
综上所述，安全工程师在工作中面临诸多问题和挑战，需要不断提高自身的专业能力、沟通能力和安全意识，同时，企业和行业也需要加强对安全工程师的重视和支持，以提高整个行业的安全水平。