监理工程师的收费方式主要有以下几种：
按工程造价的百分比计取
监理工程造价在500万元及以下的，不得小于2.5%；
监理工程造价在500万元到1000万元的，收取1.9%至2.5%；
监理工程造价在1000万元到5000万元的，收取1.3%至1.9%；
监理工程造价在5000万元到1亿元的，收取1.1%至1.3%；
监理工程造价在1亿元到5亿元的，收取0.7%至1.1%；
监理工程造价在5亿到10亿元的，收取0.5%至0.7%；
监理工程造价在10亿元以上的，不得大于0.5%。
按月收费
可以按照每月工作时间和工作量来计算，一般来说，监理工程师的月薪在1万元以上，但具体收费标准还要根据工程的规模、复杂程度、工作内容和监理工程师的经验水平等因素来确定。
按参与监理工作年度平均人数计算
3.5万元/人·年。
固定价格计算法
建设单位与工程监理企业在协商一致的基础上形成的监理合同固定价格，实践中可进一步分为固定总价和固定单价计算法。这种方法适用于监理工作内容明确的中小型工程监理费的计算。
工资加一定比例的其他费用计算方法
以项目监理机构监理人员的实际工资乘以一个大于1的系数，系数通过综合考虑应有的其他直接费、间接成本、税金和利润来确定。
综合费用法和综合费率法
工程监理费=∑（各类监理人员综合费用×相应监理人员数量×相应监理人员服务时间）×工程复杂程度调整系数；
工程监理费=计费额×综合费率×工程复杂程度调整系数。计费额是指工程概算投资额中的建筑安装工程费、设备与工器具购置费和联合试运转费之和。
在选择具体的收费方式时，监理工程师和业主应根据工程的具体情况、双方的协商以及市场行情来确定最合适的收费方法。